Zalety stosowania Dwutlenku chloru w porównaniu z Chlorem.
Większa wydajność i wyższa efektywność kosztowa – Dwutlenek chloru ma wyższą zdolność utleniania i niższą siłę utleniania niż większość rodzajów chloru, co czyni go co najmniej 2,6 razy silniejszym na 1 ppm.
Brak rakotwórczych produktów ubocznych i brak złego smaku w wodzie – Dwutlenek chloru w przeciwieństwie do chloru działa tylko poprzez utlenianie i nie łączy się ze związkami organicznymi, tworząc niebezpieczne produkty uboczne, takie jak trihalometan (THM) i inne chlorowane związki organiczne, które zostały wymienione jako potencjalnie rakotwórcze.
Mniej korozyjny – Dwutlenek chloru ma niższy potencjał utleniania i nie hydrolizuje z wytworzeniem kwasu, a zatem jest mniej korozyjny.
Działa w szerokim zakresie pH – Skuteczność chloru zależy od pH i jest niemal nieskuteczna powyżej pH5, a pochodnym chloru drastycznie spada moc biobójcza już w wodzie powyżej pH7.
Dwutlenek chloru jest skuteczny przy wszystkich wartościach pH poniżej 12. 
Skuteczny przeciwko złożonym organizmom – ClO2 niszczy cysty i pierwotniaki, w tym Cryptosporidum, Giardia, Ameba i wiele innych w odróżnieniu do wolnego chloru, którego skuteczność w tej materii jest znacznie ograniczona.
Niszczy biofilm całkowicie u źródła – przez penetrację warstw polisacharydów w celu zniszczenia pseudomonas, legionella i innych bakterii bazowych biofilmu – wolny chlor nie ma takiej zdolności.
Większa skuteczność– Dwutlenek chloru działa biobójczo na całej długości instalacji wodnej.